Il Lattosio è lo zucchero del latte, e rappresenta praticamente la totalità dei carboidrati che contiene qualsiasi tipo di proteina Whey.
La WPI è la fonte di proteina del siero del latte con i livelli più bassi di carboidrati e, quindi, di lattosio, poiché il trattamento della membrana con il quale viene elaborata la proteina filtra questo zucchero riducendolo notevolmente .
La maggior parte delle proteine del siero del latte isolate contiene tra l'1 e l'1,5% di lattosio, quantità tollerabili dalla maggior parte degli intolleranti al lattosio. Anche così, la WPI non è considerata un prodotto senza lattosio secondo le normative europee.